Fondacija dr Zoran Đinđić osnovana je 15. decembra 2003. godine nakon ubistva premijera Srbije dr Zorana Đinđića.
"Namera osnivača Fondacije je da sačuvaju trajno sećanje na Zorana Đinđića i da nastave njegove ciljeve da Srbija postane moderna država, lider na Balkanu, ali i važan faktor događaja u Evropi", rečeno je na konferenciji za štampu u Vladi Republike Srbije prilikom osnivanja.
Osnivačkim dokumentima definisani su iosnovni ciljevi Fondacije: podsticanje i razvoj naučno-istraživačkih delatnosti u oblastima koje doprinose unapređenju demokratskih odnosa i političke kulture u društvu, organizovanje humanitarnih i drugih aktivnosti.
Fondacija Zoran Đinđić bavi se čitavim nizom aktivnosti koje imaju za cilj da omoguće srpskim studentima i mladim ljudima program stipednija i radnih praksi u Nemačkoj i Austriji, kao i mogućnost usavršavanja i napredovanja u Srbiji.