Bošnjački Institut je osnovan 1988. godine u Cirihu. Smješten je u ulici Sonneggstrasse 4, u okviru univerzitetskog kompleksa. U njoj su bili smješteni biblioteka, arhiv, tehnička oprema, umjetnička zbirka i što je najvažnije knjižni fondovi Instituta, te prostori za naučnoistraživački rad. U samom potkrovlju Instituta nalazile su se gostinjske sobe i knjigoveznica. Jezgro biblioteke je bio odjel Bosnika koja je sadržavala veċinu knjiga, rukopisa, dokumenata i časopisa o Bosni i Hercegovini, na bosanskom, arapskom, turskom, engleskom, francuskom i brojnim drugim svjetskim jezicima, kao i radove bosansko-hercegovačkih autora iz svih područja ljudskog znanja, umijeċa i aktivnosti. Tu je također i Zbirka rukopisa koja broji više stotina originala iz raznih oblasti, kao što su pravo, politika, religija, medicina, astrologija, muzika iz perioda od 13. do 19. stoljeća. Danas se Institut nalazi u Sarajevu. Kompleks Instituta sačinjavaju zgrada biblioteke u kojoj su smještene knjige, arhiv dokumenata, video i audio arhiv, zbirka likovnih djela, kabineti za naučno-istraživački rad, čitaonice, sala za konferencije, te drugi popratni sadržaji i Gazi Husrev-begov hamam, u kojem su smješteni eksponati i koji je u funkciji kulturnog centra. Za arhitektonsko rješenje Bošnjačkog instituta, zgradu biblioteke i uspješnu restauraciju Gazi Husrev-begovog Hamama, koje predstavlja spoj moderne i orijentalne arhitekture. Bošnjački institut je otvoren za sve koji se bave naučnim radom na temu kulturne i političke historije Bosne i Hercegovine i Bošnjaka, kao i geopolitičkog i kulturnog kontksta ove zemlje i naroda, historičarima, političarima, studentima i žurnalistima. Bošnjački institut posjeduje i veliku Zbirku umjetničkih djela. Ona sadrži zbirku likovnih djela Bošnjaka u kojoj su zastupljena 132 autora sa preko 650 djela. U toj zbirci posebno mjesto zauzima stalna izložbena postavka Mersada Berbera sa preko 70 umjetničkih djela. Tu je još i zbirka djela umjetnika sa prostora bivše Jugoslavije, kao i zbirka stranih umjetnika sa dvije kolekcije akvarela austrougarskih slikara-oficira Eduarda Loidolta i Edmunda Misere, čiji su radovi inspirisani bosanskohercegovačkim motivima.