Lična biblioteka nalazila se u vlasništvu Z. Đinđića do atentata 2003. godine. Potom se nalazila u vlasništvu porodice Đinđić sve do momenta kada je predata Fondaciji Z. Đinđića 2009. godine (prvi deo) i 2016. (drugi deo). U saradnji sa Narodnom bibliotekom 2008. godine je urađena katalogizacija, odnosno popis svih knjiga i Narodna biblioteka je vlasnih kataloškog indeksa. Knjige se čuvaju u Fondaciji Zoran Đinđić, ali upravljačka prava nad zbirkom dele Narodna biblioteka i fondacija.